淋巴瘤中的基因突变是怎么回事？
根据发表在《血液进展》上的一项系统综述和荟萃分析，与诊断时相比，在临床转折点(如疾病复发和进展)中，套细胞淋巴瘤(MCL)患者的突变频率有增加的趋势。
由MD安德森医学博士Michael L. Wang领导的作者回顾了在基线时采集的2275例MCL肿瘤或骨髓样本的遗传学，观察到近一半(43.5%)含有突变的ATM。第二个最常见的突变基因是TP53(26.8%)，其次是CDKN2A(23.9%)和CCND1(20.2%)。细胞遗传学方法还检测到IGH(38.4%)和MYC(20.8%)的畸变。其他常见的基线突变包括NSD2(15.0%)，KMT2A(8.9%)，S1PR1(8.6%)和CARD11(8.5%)。
研究作者还确定了突变频率差异最高(> 5%)的基因。这些包括TP53，ATM，KMT2A，MAP3K14，BTK，TRAF2，CHD2，TLR2，ARID2，RIMS2，NOTCH2，TET2，SPEN，NSD2，CARD11，CCND1，SP140，CDKN2A和S1PR1。
根据汇总分析，研究作者关注了164个中的32个基因，这些基因在至少一项研究中被发现经常发生突变。Wang等人发现，在基线时，这32个基因发生遗传突变的总体概率为11.3%(95%CI，9.3%-13.4%)。对于复发或进展后再次进行测试的患者，这些基因之一发生突变的可能性增加到18.4%(95%CI，14.9%-22.4%)。他们写道：“这些像差在克隆进化和扩展中作为驱动突变的致癌作用应进一步研究，”他们写道。“可以使用具有最高突变率的基因与基因的反复突变区域相结合来构建针对MCL的靶向研究组，以了解其在新型精密疗法时代的临床意义。”
在疾病进展时，最常见的基因突变是ATM(57.6%)，TP53(43.0%)，CDKN2A(29.5%)和CCND1(27.7%)。
从基线到疾病进展的最大差异在于TP53基因，该频率在基线为26.8%，在疾病进展时为43.0%(贝叶斯概率，0.998)。
作者对3个主要数据库进行了文献检索，以寻找报道MCL患者遗传突变的原始研究，包括随机临床试验，前瞻性研究，回顾性研究和病例报告。他们排除了仅报道常规细胞遗传学(例如获得，缺失和易位)以及不含基因突变数据的基因表达数据的研究。
提取的数据包括突变数据(基因是否被突变)，研究类型(观察性或实验性)，用于分析突变的技术，样品收集时间点(基线/诊断，复发，进展)以及是否采用特定治疗或疗法在研究中被命名。他们收集了研究水平和患者水平的数据。在最初确定1577项独特研究后，Wang等人剔除了不符合纳入标准的研究，直到将剩下的32项纳入最终分析。
纳入的32项研究包括来自2127位患者的2275个样本。总体而言，在2127例MCL患者中，有2045例具有基线样本，其中包含32个基因中至少1个的遗传突变信息。前基因组时代的研究通常使用Sanger测序，荧光原位杂交和聚合酶链反应等技术来鉴定突变。最近的研究经常使用单核苷酸多态性阵列和下一代测序(NGS)。
在评估他们论文的优缺点时，Wang等人强调将患者水平的数据包括进来可以提高数据的质量和可靠性。尽管付出了很大的努力，但他们注意到，由于MCL的稀缺性以及迄今为止完成的相对较少的基因研究，他们的研究仍受到小型研究的影响。此外，MCL组织库用于许多基因分型/测序研究，因此有可能某些患者样本已用于多项研究。他们写道：“但是，我们认为在32项研究中观察到的每位患者均对该特定研究具有独特的基因分型/测序，并且代表了独立的观察结果。”
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研究作者还确定了突变频率差异最高(> 5%)的基因。这些包括TP53，ATM，KMT2A，MAP3K14，BTK，TRAF2，CHD2，TLR2，ARID2，RIMS2，NOTCH2，TET2，SPEN，NSD2，CARD11，CCND1，SP140，CDKN2A和S1PR1。
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